Literature Workflow for Medical Research

基于 Obsidian + Zotero + PaddleOCR 的医学文献精读工作流，支持自动 OCR、深度阅读笔记生成和队列管理。

支持多 Agent 平台: OpenCode / Claude Code / Cursor / Windsurf / GitHub Copilot / Cline / Augment / Trae / 自定义

快速开始

方式一：让 Agent 帮你配置（推荐）

复制以下内容，粘贴给你的 AI Agent，它会自动完成全部配置：

Install and configure the literature workflow by following the instructions here:
https://raw.githubusercontent.com/LLLin000/Research-workflow/main/docs/INSTALLATION.md

Agent 会问你几个问题（Agent 平台、Vault 路径、文件夹命名偏好），然后自动完成安装、配置和验证。

方式二：手动安装

需要：

• Python 3.10+
• Zotero（安装 Better BibTeX 插件）
• Obsidian
• PaddleOCR API Key

# 1. 克隆仓库
git clone https://github.com/LLLin000/Research-workflow.git
cd Research-workflow

# 2. 安装 Python 依赖
pip install -r requirements.txt

# 3. 运行安装脚本
python scripts/setup.py

安装脚本会引导你：

1. 选择 Agent 平台（决定 skill 文件存放位置）
2. 配置 Vault 目录结构（可自定义系统文件夹、文献目录等名称）
3. 配置 Zotero 路径
4. 部署工作流脚本

功能特性

• /LD — 文献速览（单篇或批量）
• /LD-deep — 深度精读（Keshav 三阶段阅读法）
• 自动 OCR 提取（PaddleOCR-VL API）
• Zotero 双向同步
• 文献队列管理（Base 集成）
• 科研读图指南（14 种图表类型）

文档

• 安装指南
• 使用指南
• 读图指南

License

MIT License — 允许商业使用，需保留版权声明。